La végétation du pays sous une apparente monotonie est en fait d'une grande diversité.
 
Celle-ci est liée à deux principaux facteurs :
1° Naturels d'une part, ce sont : le climat, l'altitude et la nature des sols ;
2° Humains d'autre part, ils se traduisent par la récolte du bois de feu et de construction et l'exploitation pastorale.

A Djibouti, zone tropicale sèche, le facteur décisif est la pluviosité qui obéit à l'altitude et à l'orientation des versants. Ainsi, dans les massifs des monts Goda et Mabla, la densité de végétation et la taille des arbres croissent avec l'altitude.
A Djibouti, la nature du sol joue un rôle très secondaire. L’action de l'homme et le pastoralisme sont, en revanche, en partie responsables de la dégradation remarquée dans certaines régions.
 
 
Différents types de végétation :
 
La végétation des montagnes et des hauts plateaux
 
La végétation des collines et des plaines
 
La végétation de la République de Djibouti est assez variée. Cependant, on peut constater que les zones les plus riches (forêts notamment) sont en train de disparaître. De plus en plus, l'élevage ovin, plus dangereux pour la végétation que les bovins, se développe et la dégradation tend à s'accroître.